TotalCommander, Cambiar la ruta del archivo de configuración.

TotalCommander guarda su configuración en wincmd.ini y wcx_ftp (Para las conexiones ftp), en el momento de instalación una de las opciones es seleccionar donde se guardan esos archivos, y esa información se almacena en [HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE\Ghisler\Total Commander]

Windows Registry Editor Version 5.00

[HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE\Ghisler\Total Commander]
"InstallDir"="C:\\Program Files\\totalcmd"
"IniFileName"="%APPDATA%\\GHISLER\\wincmd.ini"
"FtpIniName"="%APPDATA%\\GHISLER\\wcx_ftp.ini"

También se puede especificar pasando como parámetro al momento de ejecutarlo, se puede agregar un bat o modificar el acceso directo.

totalcmd.exe /i=ruta\wincmd.ini /f=ruta\wcx_ftp.ini

Otra configuracion importante, es la del pulugin sftp

Windows Registry Editor Version 5.00

[HKEY_CURRENT_USER\Software\Ghisler\Total Commander]

[HKEY_CURRENT_USER\Software\petrich\tc_sftp_plugin]
"SFtpIniName"="ruta\\wcx_sftp.ini"

https://www.ghisler.com/